به کارگیری 3 روش متفاوت استخراج DNA برای آنالیز بقایای ژنومی DNA در روغن خام و تصفیه شده سویا

Authors

  • ابوالفضل کامکار گروه بهداشت و کنترل مواد غذایی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران- ایران
  • افشین آخوندزاده گروه بهداشت و کنترل مواد غذایی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران- ایران
  • ایرج اشرافی گروه میکروبیولوژی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران- ایران
  • غزال نعمتی گروه بهداشت و کنترل مواد غذایی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران- ایران
  • نگین نوری گروه بهداشت و کنترل مواد غذایی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران- ایران
  • پرویز شایان موسسه Molecular Biological System Transfer(MBST)، تهران- ایران|گروه انگل شناسی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران- ایران
Abstract:

زمینه مطالعه: روغن سویا یکی از پرمصرف ترین روغن‌های گیاهی در جهان است. این روزها، استفاده از دانه‌های سویا اصلاح ژنتیکی شده برای تولید روغن سویا به طور مداوم در حال افزایش می‌باشد. روش مناسب برای تشخیص گیاهان اصلاح ژنتیکی شده در روغن و غذا با میزان بالا فرآوری، روشی است که بر پایه آنالیز بقایای ژنتیکی موجود در غذا باشد. کارایی و تکثیر موفق DNA استخراج شده، شدیداً به روش مورد استفاده برای استخراج DNA از روغن وابسته است. هدف: به کار بردن 3 روش مختلف استخراج DNA برای بررسی بقایای ژنتیکی موجود در روغن به منظور دستیابی به DNA با خلوص بالا می‌باشد. روش کار: روش‌های استخراج بر اساس اتصال اختصاصی DNA به غشا‌های سیلیکایی (ستون) و رزین طراحی شده اند. آنالیز DNA استخراج شده با روش PCR و با استفاده از جفت پرایمرطراحی شده از ژن 18S rRNA و 5.8S rRNA  و پرایمر اختصاصی مشتق شده از ژن لکتین گیاه سویا انجام شد. نتایج: در این مطالعه، با استفاده از روش 1، DNA قابل تکثیراز نمونه‌های روغن سویا استخراج نشد. در روش 2، روغن ابتدا با PBS مخلوط و سپس با استفاده از ایزوپروپانول رسوب داده شد، در این روش نیز تکثیر مشاهده نشد اما میزان OD260 کاهش یافت. در روش 1و 2 DNA استخراج شده جهت تکثیر به میزان کافی خالص نبود.  برای حذف مؤثرتر آلودگی، روش 3 که ترکیبی از روش 2 به همراه کلرفرم بود، استفاده گردید که DNA استخراج شده از تمامی نمونه‌ها با موفقیت‌ تکثیر شدند. نتیجه‌گیری‌نهایی: اعتقاد ما بر این است اگر چه یکی از مشکلات استخراج DNA در ماده غذایی کمی میزان DNA موجود در روغن می‌باشد اما در واقع مهمترین نقش را در موفقیت تکثیر DNA استخراج شده از روغن، خلوص آن دارد. روش 3 می‌تواند به عنوان روش مناسبی برای جدا سازی DNA خالص از روغن سویا مورد استفاده قرار گیرد.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

بهینه سازی استخراج DNA ژنومی باکتریایی به روش سیلیکاژل

Background & Objectives: Today, major progress has been made in molecular experiments. The first step towards improving these experiments is the accurate extraction of nucleic acid. In this study, a protocol for DNA extraction was proposed in accordance with silica gel method. DNA purification, developed based on the silica-gel-membrane technology, is a simple method, which involves three s...

full text

معرفی روش ساده و آسان برای استخراج DNA ژنومی در قارچ‌های رشته‌ای

امروزه روش­های مولکولی لازمه انجام بسیاری از تحقیقات می‌باشد. اساس کار اکثر این آزمایشات و تحقیقات مولکولی بر پایه استخراج DNA می‌باشد، از این رو انتخاب و کشف روش جدیدی که در عین نتیجه بخش بودن، کم هزینه، ساده، کم خطر و سریع نیز باشد بسیار حائز اهمیت است. تکنیک‌های معمولی که در بخش کشاورزی جهت استخراج DNA قارچ­های رشته­ای مورد استفاده قرار می‌گیرد شامل C-TAB، فنل کلروفرم و کیت­های آزمایشگاهی اس...

full text

بهینه سازی استخراج dna ژنومی باکتریایی به روش سیلیکاژل

سابقه و هدف:در عصر حاضر، آزمایشات مولکولی گسترش بسیاری پیدا نموده است. اولین گام در موفقیت این آزمایشات استخراج صحیح اسید نوکلئیک می باشد. در این مطالعه، دستور کاری برای استخراج dna براساس سلیکا ارائه گردیده است. خالص سازی dna براساس تکنولوژی غشاء سیلیکاژل یک روش ساده و شامل سه مرحله اتصال، شستشو و بازیابی می باشد. اسیدهای نوکلئیک برخلاف پلی ساکاریدها و پروتئی نها، در حضور نمک های کائوتروپیک ( ...

full text

معرفی روش ساده و آسان برای استخراج dna ژنومی در قارچ های رشته ای

امروزه روش­های مولکولی لازمه انجام بسیاری از تحقیقات می باشد. اساس کار اکثر این آزمایشات و تحقیقات مولکولی بر پایه استخراج dna می باشد، از این رو انتخاب و کشف روش جدیدی که در عین نتیجه بخش بودن، کم هزینه، ساده، کم خطر و سریع نیز باشد بسیار حائز اهمیت است. تکنیک های معمولی که در بخش کشاورزی جهت استخراج dna قارچ­های رشته­ای مورد استفاده قرار می گیرد شامل c-tab، فنل کلروفرم و کیت­های آزمایشگاهی اس...

full text

به کارگیری روش‌های خوشه‌بندی در ریزآرایه DNA

Background: Microarray DNA technology has paved the way for investigators to expressed thousands of genes in a short time. Analysis of this big amount of raw data includes normalization, clustering and classification. The present study surveys the application of clustering technique in microarray DNA analysis. Materials and methods: We analyzed data of Van’t Veer et al study dealing with BRCA1...

full text

بررسی کمی و کیفی dna بلدرچین، استخراج شده با روش نمکی تغییر یافته و توالی¬یابی ژنومی آن

استخراج dna به­صورت خالص، پایدار و با کمیت و کیفیت مناسب، گام مهمی در اجرای پژوهش­های بیولوژیکی می­باشد. در این پژوهش، dna مربوط به نمونه خون 600 بلدرچین ژاپنی با روش نمکی تغییر یافته با پودر رختشویی و بدون استفاده از آنزیم پروتئیناز k استخراج شد. نمونه­های dna به­دست آمده در مراحل آماده­سازی کتابخانه ژنومی، با نانودراپ، فلئورومتر، بیوآنالیزر، الکتروفورز، pcr، هضم با آنزیم­های آندونوکلئاز، اتصا...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 71  issue 1

pages  83- 89

publication date 2016-03-20

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023